Если ехать Сначала в Прагу, а из нее в Вену, нужно одну делать визу или две, в Чехию отдельно в Вену отдельно?

если основная страна вашего пребывания Чехия, вам оформляется шенген через чешское консульство, а оттуда вы имеете право колесить по всем странам шенгенского союза. . ВИЗА ОДНА - шенген..)

Если большую часть времени Вы планируете проводить в Вене, то визу надо делать Австрийскую, даже если въезд в Шенген будет через Чехию. А виза одна действует на всю шенгенскую зону.

из праги можете ехать куда хотите, хоть в париж, никто даже паспорт не спросит

Шенген на всё!

Одну - лучше в Чехию.

Вы из Праги можете и до Дрездена доехать (очень рекомендую) . И всё по одной визе. Европа...

Одна на всё

Куда бы вы не поехали - будь то Прага или Вена - вам в любом случае надо делать шенген. Шенгенская виза действует во всех странах, которые входят в шенгенскую зону - 25 стран вроде бы. Поэтому имея эту визу на руках вы можете свободно перемещаться как по любой из этих стран, так и из страны в страну.
В данном случае, если вы уже определили именно эти две страны, советую вам посмотреть в каком посольстве шенгенскую визу получить проще: в австрийском, или в чешском. Требования у всех стран разные. Например самый легкий в получении шенген - это финский. Где легче - дешевле, меньше документов нужно - там и открывайте. Есть еще один ньюанс. Желательно вьезжать в шенгенскую зону именно через ту страну, которая вам эту визу выдала.

Шенгенская виза действует в обеих странах.