Почему нач. паспортного стола не хочет давать разрешение на временную регистрацию моей сестры в моей собств квартире?

Может быть Вы имели ввиду регистрацию по месту пребывания?
Начальник паспортного стола и не имеет возможность разрешить или не разрешить регистрацию по месту пребывания в квартире, принадлежащей Вам на правах собственности. Жилконторы могут дать согласие или отказать в регистрации только в муниципальных квартирах, частная собственность в этом случае не в их компетенции.
Зачем Вы к нему вообще пошли? Вам прямая дорога в подразделение УФМС, обслуживающее территорию, на которой Вы проживаете. И никого не интересуют ваши родственные отношения. Вы имеете право зарегистрировать в своей квартире любого гражданина России без согласования с паспортным столом жилконторы.

Мало того, не только регистрация по месту пребывания, но и регистрация по месту жительства не дает никакого права претендовать кому-либо на жилое помещение, принадлежащее Вам и Вашим детям на правах собственности!

должны дать согласие все собственники

просите письменный отказ
и идите напрямую в УФМС
скорее всего вопрос в том что дети являются собственниками

Не проще ли спросить об этой у него самого?

Берите у него письменный отказ. Там должно быть законное основание. Не видя этого, ответить на вопрос не представляется возможным. Мало ли какая у вас там ситуация. Вы единственный собственник?

Надо что бы кто прописан в квартире еще, дали согласие.

Если сестра родная, то отказать не имеют права. В этом случае даже согласия прописанных не требуется.