2 года назад получила РВП на 3 года (печать в загран паспорте).

1. Выпроживать не имеете права, в каком-либо городе, кроме того, где получили РВП. В отделении ФМС Питера, можете узнать - относится ли выданное вам РВП к области города, его выдашего. Если РВП, выданные в области, не включают проживание в Питере (область то большая) , то регистрироваться можно будет только! там где выдавали.
2. После получения разрешения на временное проживание либо вида на жительство иностранный гражданин обязан зарегистрироваться по месту жительства в течение 7-ми рабочих дней (согласнозакону «О правовом положении иностранных граждан в Российской Федерации») . То есть - этот пункт вы уже нарушили. О наказании за него, вы сможете узнать, когда придете становиться на учет. Более того, с 15 января 2007 года, ежегодно! вы обязаны предоставлять в ФМС уведомление с подтверждением проживания в РФ. http://www.fmsmoscow.ru/rvp_text.php?nid=68& - этого его форма. Кроме того, вы обязаны были получить ИНН (в любом случае) и пенсионное (если вы работаете) .
3. Подать документы на гражданство вы можете на сегодняшний день, только до 01.01.2009 по ст. 14 закона о гражданстве. По истечении этого срока, либо прожить дольше в РФ и пройти по другой статье, либо ждать - а вдруг ст. 14 продлят до 01.01.10 (как это делалось в течение нескольких последних лет) . Для этого Вам нужно просто прийти и подать документы. Список есть на сайте www.fmsmoscow.ru. Естественно, перед подачей заявления на гражданство, вы должны урегулировать все вопросы по Вашей регситрации, и при необходимости заплатить штрафы.
Удачи.

можете - и то, и другое.