как находясь в России поменять фамилии в паспорте

В Российской миграционной службе ваш украинский паспорт вам, естественно, никто не поменяет. И не потому что они плохие и не хотят этим заниматься, а потому, что имеют право менять только паспорта граждан России.
Внутренний Укр. паспорт вы можете поменять только на территории Украины; загранпаспорт украинский вам могут оформить в консульстве Украины в РФ. Других вариантов нет.

Жена пересекла государственную границу РФ по паспорту, недействительному после брака и смены фамилии. А теперь хотите, чтобы этим занималась ФМС. Так этим другие органы должны заниматься.

Статья 322. Незаконное пересечение Государственной границы Российской Федерации

1. Пересечение Государственной границы Российской Федерации без действительных документов на право въезда в Российскую Федерацию или выезда из Российской Федерации либо без надлежащего разрешения, полученного в порядке, установленном законодательством Российской Федерации, -
наказывается штрафом в размере до двухсот тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до восемнадцати месяцев, либо принудительными работами на срок до двух лет, либо лишением свободы на тот же срок.

гражданство какое?

Впрочем - это без разницы, если вы иностранцы- никто вам в России ничего делать не будет.

только в родном посольстве сможете паспорта поменять

Они обязаны этим заниматься.

Незнаю))

штрихом замазать и новую написать, вообще прикольно будет

в загс иди документы подавай и там надо платить за смену фамилии