У моей собаки, разные глаза (порода шелти), может ли он принимать участие в выставках?

Глаза: преимущественно раскосого типа, среднего размера, карего окраса. У представителей Мерль (голубого) – голубой, могут быть двух сетов коричнево и голубого, либо пигментированные не полным цветом. Взгляд всегда прямой и внимательный, осознанный. Существует несколько окрасов для Шелти:

Трехцветный (триколор) – ведущий цвет черный, по телу распределены пятна от бурового до красно – рыжий цветов, есть незначительный белый цвет.
“Блю – Мерль” (голубой мрамор) – шерсть голубоватого оттенка, красивые переливы серебряного, многочисленные пятная черного, не крупные, с плавным градиентом. Могут быть в маленьком количестве – рыжие и белые пятна.
Соболь – от песочного светлого, до ярко золотого и огненно-рыжего. Главное условие – яркость и отсутствие серых пятен по корпусу.
Черно – белый: могут быть бурые пятна, яркая представительница, эффектнее смотрится чистый черный с белыми пятнами.
Шелти мраморная – одна из предпочтительных у владельцев, окрас смотрится необычно и привлекательно, у таких собак могут быть разные глаза, либо же чисто голубые. У все животные желательны пяты белого цвета: на груди, животе и лапах (кроме черных и бурых).

Он мраморный? Никаких проблем, может. Он рыжий или трик? У вас проблема

ага . если не запрещено правилами породы

Смотря какая расцветка.
Из стандарта породы:
Глаза: Среднего размера, косо посаженные, миндалевидной формы с черными обводками. Темно-коричневые, за исключением мраморных собак, у которых один или оба глаза могут быть голубыми или с голубыми вкраплениями
Подробнее можно прочитать тут - http://sheltie-nkp.ru/breed/standart.html