Что управляет мыслями?

гормоны!

Человеческая воля.

Голова

Убеждения.

Углеводы

мозг формирует вопрос, получая ответ из вне, он его фиксирует, начинает осознавать полученную мысль

чувство

Мозг управляет нашими мыслями.

...бесконечность, где дискретных вариантов=мыслей - нет априори, ибо процесс един...

Подсознание.

Желания

Мысли приходят и уходят, как облака в небе и с этим нет никаких проблем

Сознание, психика (в т. ч. эмоции, впечатления, другие мысли, желания, настроения...), информационные процессы, физико-химические процессы в мозгу... Еще можно сказать - внешние воздействия, предшествующий опыт...
Ответов на Ваш вопрос может быть много, и все верны, но с разных точек зрения.

Я где-то слышал такую вещь, что например прежде чем мы подумаем сделать ли какую вещь, например, подвигать рукой, уже за несколько моментов времени об этом, без нашего на то согласия, в мозге фиксировалась нейронная активность, которая и активирует те действия которые мы уже потом подумав хотим, якобы "сами", предпринять. Тут не все так однозначно. Т. е. прежде чем подумать, что-то уже подумало за нас.

Для последнего, «телепатического», эксперимента было набрано четыре участника. Один из них стал «передатчиком», на него надели устройство связи «мозг-компьютер» (BCI, brain-computer interface). Остальные три участника стали «приёмниками», на них закрепили устройства связи «компьютер-мозг» (CBI). С помощью энцефалографии мысленно произнесённые «передатчиком» слова были переведены в бинарный вид и отправлены по почте в из Индии во Францию. Там эти данные были конвертированы в электромагнитные импульсы и с помощью транскраниальной магнитной стимуляции были «транслированы» в мозги трёх «приёмников». Для испытуемых это выражалось в возникновении фосфенов, световых вспышек в глазах. Сосчитав количество вспышек в нескольких последовательностях, «приёмники» смогли расшифровать послание.

сознание

Мыслями управляет сложный человеческий мозг, разум. Оттуда сознание и подсознание. Управляет сверхсознание и сверхподсознание. а ими управляет информационное поле земли, биосфера - разумная оболочка земли.

Твоими ты.

мозг

психическая энергия. водолей. интернет\как электромагнитный панцырь, закрывая от мыслей высокой духовной частоты\

мозг

Причина управляет мыслью