Почему невинно убиенные христиане становятся святыми, а вот когда христиане уничтожали людей тысячами, то это еретики.

Всяко бывало. И так, как вы пишете тоже бывало.

Е́ресь (греч. αἵρεσις — «выбор, направление, мнение» ) — сознательное отклонение от догматов веры, предлагающее иной подход к религиозному учению; выделение из состава церкви новой общины. Не следует смешивать с расколом.

Следует иметь в виду, что в библейских текстах на греческом языке термин αἵρεσις используется в ином значении, как, например, в Первом Послании Павла к Коринфянам: δεῖ γὰρ καὶ αἱρέσεις ἐν ὑμῖν εἶναι, ἵνα οἱ δόκιμοι φανεροὶ γένωνται ἐν ὑμῖν. В русском синодальном переводе в данном месте слово переведено как «разномыслие» : «Ибо надлежит быть и разномыслиям между вами, дабы открылись между вами искусные» (1Кор. 11:19).
В греческом языке термин первоначально использовался в значении «выбор, направление, течение» . В иудео-эллинистической культуре, на фоне которой зародилось и развивалось христианство, этим термином обозначали «философские или религиозные школы» [1]. К примеру, так называли иудейские религиозно-политические партии [2] — фарисеев и саддукеев (см. Деян. 5:17; 15:5; 26:5). Соответственно, это понятие изначально носило описательный, вполне нейтральный характер. Именно в этом смысле иудеи называли первых христиан «назорейской ересью» (Деян. 24:5).

Негативный смысл слово «ересь» впервые приобретает в новозаветных посланиях. Логика этого превращения такова, что, поскольку истину и жизнь человек может обрести только во Христе (Ин. 14:6), любая альтернатива автоматически обрекает человека на погибель. Соответственно, апостол Пётр говорит о «пагубных ересях» (2Пет. 2:1), а апостол Павел помещает «ереси» в один ряд с грехами волшебства и идолослужения (Гал. 5:20). Следуя примеру апостолов, ранняя христианская церковь использовала термин «ересь» для обозначения учения, расходящегося с христианской ортодоксией, или группы людей, отколовшихся от Церкви вследствие приверженности такому учению.
Вот и подумайте, что это за люди, еретики. хотя назвать еретиком может каждый.
Жгли на кострах не только христиане, и не только христиан. В те времена это вообще было модно: публичное умерщвление человека, в назидание другим. И у язычников это процветало, в свое время.

Все рождается от неверного истолкования святых писаний.

Христиане народ уничтожали тысячами? Вы ошиблись. В тот раз комиссары лютовали.

Нет хороших и плохих, есть лишь свои и чужие

убиенных щадят, отпевают и балуют раем
(В. Высоцкий)
просто русский менталитет такой, жалеть лохов...