Как просходит переход от естественного к сверхъестественному богопознанию? Прошу отвечать знающих людей.

Если в процессе естественного богопознания (и других промежуточных формах) часть человеческой энергии "обесценивается" (т. е. не приносит плода) , то в сверхъестественном вся внутренняя энергия личности, по особенному действию Духа Божия, преобразовывается в энергию обожения человеческого естества. При этом разум персоны, освобождённый от умствований, имеет определённые суждения, а именно:
1) абсолютная Истина есть, т. е. Она- безусловная реальность;
2) Она познаваема, т. е. Она- безусловная разумность;
3) Она дана, как факт, т. е. является конечной интуицией, но Она абсолютно доказана, т. е. имеет строение безконечной дискурсей (бесконечных логических умозаключений) . Откровения от Бога познаются в опыте благодатной жизни. Дух Святой невидимо даёт душе знания. Это знание есть основа созерцания, есть "начало" обожения. И личность всем своим "я" живет реальностями Божественного мира и созерцает их как очевидности.

Ну, во-первых, нет сверхестественного.
Есть силы природы, которые более тонкие и которые не познаны.
Есть мир эйдосов - идей, в соответствии с которыми создан человек и мироздание.
То, что воспринимается человеческими чувствами и интеллектом, это мир иллюзий, а мир действительности, мир духоразумения, или того, что называют извращенным теперь словом оккультизм, это и есть мир действительности.
Истинное познание, истинная суть вещей, или, как говорил И. Сирин -"пламень вещей", вот это и есть духоразумение, само- и Бого- познание, неотделимые друг от друга.
Обучение идет не умом, а по естеству, погружением знающим этот мир - не знающего.
Потому Христос и говорил, что если слепой - не знающий этого мира истины, ведет слепого, то обы они упадут в яму.
Такое обучение на востоке называется "Доктрина сердца" - погружением по-естеству.
Христос сказал проще "Блаженны чистые сердцем - ибо Бога узрят"
Если перевести правильно, то получится.
Блаженны, в переводе с греческого - правильно идущие.
Чистое сердце, это сердце развитое до чувстования тонких сил мироздания.
Бога узрят - познают.
"Радуйтесь правильно идущие, прикоснувшиеся к миру действительности, вы познаете истинно"

А теперь подробнее
"Мир силы есть мир Оккультизма и единственный, куда высочайшие Адепты погружаются для исследования тайн бытия. Следовательно никто, кроме этих посвященных, не может знать что-либо об этих тайнах. Руководимый своим Гуру (Учителем) ученик прежде всего открывает этот мир, затем его законы, затем их центробежную эволюцию в мир материи. Чтобы сделаться совершенным Адептом, требуются долгие годы, но, наконец, ученик делается властелином. Скрытое становится явным, тайна и чудо исчезли навсегда. Он видит, как направить силу в том или другом направлении, чтобы произвести желательные следствия. Тайные, химические, электрические или одические свойства растений, трав, кореньев, минералов, животной ткани так же обыкновенны для него, как перья ваших птиц для вас. Ни одно изменение в эфирных вибрациях не может ускользнуть от него. Он прикладывает свое знание и являет чудо! И он, который начал, отвергая всякую мысль о возможности чуда, тотчас же причислен к чудотворцам и либо почитаем глупцами как полубог, либо отвергаем еще большими глупцами как шарлатан! Чтобы показать вам, какова точность такой науки как оккультизм, дайте мне сказать вам, что способы, которыми мы пользуемся, все изложены для нас до мельчайших подробностей в своде уложений, в кодексе столь же старом, как и человечество, но каждый из нас должен начать с начала, а не с конца. Наши законы так же неизменны, как и законы Природы, и они были известны человеку и вечности прежде, нежели надменный боевой петух – современная наука – вылупился из яйца. Если я не дал вам modus operandi* или не начал с ложного конца, по крайней мере я показал вам, что мы строим нашу философию на опыте и выводе, если вы не предпочитаете подвергать сомнению и оспаривать этот факт, подобно всем остальным.

Учите прежде всего наши законы и воспитывайте ваши чувствования, дорогой Брат. Овладевайте вашими непроизвольными силами и развивайте в правильном направлении вашу волю и вы сделаетесь Учителем из ученика. Я не откажу дать то, на что я имею право. Только я должен был учиться пятнадцать лет до того, как подошел к доктрине о циклах и должен был сперва учиться более простым вещам. Но как бы то ни было и что бы ни случилось, я верю, что мы больше спорить не будем, что и бесполезно, и болезненно. "
Письма Махатм

Постепенно, через веру и со смирением.

через откровения и видения

Через удары судьбы. И если осозноешь их и работаешь с ними, то непроизвольно переходишь на другую ступень развития и обратной дороги уже нет.

Автор вопроса просил отвечать знающих людей, но пока только Виктор Почобут ответил, исходя из православного вероучения и возможно из своего личного опыта, который лежит в небезопасной плоскости познания Бога.

Никакого перехода нет. Есть рост на пути Богопознания, а путь этот сверхестественный.
Бог естественным путем не познается. Или Вы надеетесь увидеть Бога естественными глазами, услышать естественными ушами?

Естественное богопознание - суть природа человеческая. Свержхестественное - это откровения Божии. Перехода нет никакого. Это как Бог сам решит кому открыться.

По разному, у каждого человека индивидуально. Думаю, что всё зависит от генетического потенциала, среды, где воспитывался человек и стремления самой личности к познанию. А вообще-то при духовном росте все вещи становятся естественными, хотя со стороны кажутся сверхъестественными.

А вы впомните Савла.