При одинаковом следовании заповедям из библии верующий всё равно праведнее неверующего? Если да, то почему?

Заповеди писались для малограмотных дебилов-козопасов Передней Азии, чтобы они друг дружку не перегрызли.
А вменяемый человек живёт не по писанным заповедям, а по совести. Причём что верующий человек, что неверующий - без разницы.
Из этого и исходи.

Вера - тоже заповедь, итак, у атеиста на одну меньше.
Если компенсировал, исполнив взамен иную, которую "верующий" нарушал, тогда равны.

Верующий в Него не судится, а неверующий уже осужден, потому что не уверовал во имя Единородного Сына Божия.

Потому что первая заповедь "Я Господь, Бог твой, Который вывел тебя из земли Египетской, из дома рабства, да не будет у тебя других богов пред лицем Моим"
Неверующий не может ее выполнять.

в новом завете человек оправдывается не только исполнением заповедей, но и верой в важность жертвы Иисуса Христа, неверующие этого исполнить не могут

16 Ибо так возлюбил Бог мир, что отдал Сына Своего Единородного, дабы всякий верующий в Него, не погиб, но имел жизнь вечную.
17 Ибо не послал Бог Сына Своего в мир, чтобы судить мир, но чтобы мир спасен был чрез Него.
18 Верующий в Него не судится, а неверующий уже осужден, потому что не уверовал во имя Единородного Сына Божия.
(Иоан. 3:16-18)

А как может человек соблюдать заповедь "возлюби Бога", если он в него не верит?