Зачем делают люди обрезание? Считают, что Бог их создал не совершенными?

В пустыне с водой были проблемы.

Жертвоприношение. Отдать Богу самую ценную часть себя.

чтобы хоть как то отличать своих, первыми это стали делать семитские сектанты монотеисты около 3000 лет назад.

Традиции чтут. Еще во времена апостолов это отменили.

это было крайне необходимо в Ветхозаветные времена, с Воскресением Господа Бога Иисуса Христа, это стало не обязательным

Нет. В Библии Бог сказал следующее:
Бытие 17:10:
Вот моё соглашение с вами и с вашим потомством после вас, соглашение, которое вы будете соблюдать: каждый мужчина у вас должен быть обрезан. 11 Вы должны обреза́ть крайнюю плоть, и это будет знаком моего соглашения с вами.

После Бог делает новое соглашение:
Римлянам 2:29
29 Но тот иудей, кто таков внутри, и то обрезание, которое сделано на сердце духом, а не записанным сводом законов. Похвала такому человеку не от людей, а от Бога.
То есть как видно из 2рого стиха обрезание больше не требуется в теле. Обрезая сердце в духе это как бы говориться об очищении тела.

В древности некоторые народы, например египтяне, практиковали обрезание, то есть удаление крайней плоти полового органа у мужчин. Вот как Бог объяснил свое повеление: «Обрезывайте крайнюю плоть вашу: и сие будет знамением завета между Мною и вами» (Бытие 17:11). В этот завет, или соглашение, с Авраамом включалось Божье обещание о том, что через Авраама «все племена земные» в конце концов получат великие благословенияОно служило признаком того, что человек принадлежал к израильтянам, потомкам Авраама, которым была оказана особая честь — «им были доверены священные слова Бога» (Римлянам 3:1, 2).
Со временем народ Израиль оказался недостойным этого доверия, потому что отверг истинное Семя Авраама, Иисуса Христа. В итоге израильтяне были отвергнуты Богом, и их обрезание утратило в глазах Бога всякое значение.
В связи с этим апостол Павел послал Тита в некоторые собрания, чтобы он «исправил недостатки». Об одном таком недостатке Павел написал Титу: «Есть много непокорных, пустословов и обольщающих умы, особенно тех, кто придерживается обрезания. Уста таких надо закрывать, потому что эти самые люди разрушают целые дома, уча, чему не следует, ради нечестной прибыли» (Титу 1:5, 10, 11).