Почему христиан жестоко преследовали первые три века? Их не любили не только власть но и на бытовом уровне.

Система вещей основана на принципах противоречащая христианскому мировоззрению. Любое государственное и при нем религиозное устройство это результат силы, беспринципности, часто жестокости. Все, кто во главе этого устройства и все кто просто сидит у кормушки, если хотят сохранить теплое место, тоже должны соответствовать всем вышеупомянутым требованиям. Христианство же учило вещам несовместимых их образу жизни. Первые последователи Христа как бельмо в глазу раздражали власть имущих, ведь их праведность обличала гниль так называемых «лидеров народа». Как результат их все время преследовали и преследовали до тех пор, пока христианство само не стало частью этой системы с ее же пороками. В итоге они многие века преследовали тех, кто выкрывал их лицемерие (как пример святая инквизиция).

Один древний римлянин, разобрав христианство по полочкам, сказал: "Греки создали культуру. Мы создали силу. Но я спрашиваю вас, что может создать это учение?"

За единобожие. Язычники могли понять и простить многое, но только не отрицание их богов. Они с радостью принимали чуждые культы, делая их частью своей религии. Но вот с единобожием они бы не смирились никогда. Потому и навязали эту троицу, применяя репрессии к несогласным.

а за что любить то их?
http://radiofreevillage.com/w/Жестокость_и_насилие_в_Библии

Первохристиане - беглые рабы Церкви. Христос дал им обоснование почему не надо платить Церкви за отпущение грехов.

Истинных христиан преследовали церкви которые начали блудодействовать с царями земными и стали ими признанными

Христиане первых веков страдали, в основном, из-за гонений на них, происходящих по настоянию иудеев. Христос много неприятного сделал для иудейской веры и его учение считалось опасным.
Во-первых, его назвали Мессией, но иудеи ждали другого Мессию, который освободил бы их от владычества Рима, а затем установил бы политическое мировладычество Израиля. А Христос, как видно из эпизода про "Богу богово, а кесарю - кесарево" совершенно не собирался воплощать эти мечты.
Во-вторых, его учение обличало иудейское духовенство, называя их учение ложью.
Да и вообще, Христос вёл себя по представлением того времени для Мессии достаточно провокационно: был «друг мытарям и грешникам» (Матф. 11, 19), многократно заявлявший ревнителям закона, что блудницы и мытари предварят их в царствии Божием (Матф. 21, 31) и что Он, Мессия, пришёл как врач к больным, пришёл, чтобы взыскать и спасти погибшее (Луки 5, 31; Матф. 18, 11; Матф. 9, 1 2; Луки 19, 10). При исцелениях своих Он повторял: отпускаются тебе грехи твои, тогда как Мессия фарисейский не прощает — он и права на то не имеет — а судит.
Ну и в-третьих, Христос предсказывал, что главный иудейский храм будет разрушен - а это никакому иудею не понравится.
Ну, и кстати, опосля проповеди Христа лет через 30 храм действительно разрушили римляне, что дало основание христианам заявлять иудеям "А ведь мы говорили!". Естественно, такие слова вызывали у иудеев жуткий баттхерт и жажду крови.

Истинных христиан по сей день преследуют, и в первую очередь - духовенство, потому что изобличают духовных руководителей.
Например, католики: Бог свят, а у них ВАШЕ ПРЕОСВЯЩЕНСТВО.
В РПЦ - Владыкой называют Кирилла, в то время как Владыкой является только Бог.
Во всех церквях ОТЦЫ, а в Библии: и отцом себе не называйте никого на земле, ибо один у вас Отец, Который на небесах (Матфея 23:9)
Да и много чего еще...

В Библии предсказывалось что ИСТИННЫХ последователей Иисуса Христа, будут ненавидеть и преследовать. Так что это исполняется пророчество.