С чем связаны затруднения в понимании Писании?

Потому что Писание открывается Духом, человеку ищущему. Они не слушают Духа и не слышат

Все писание Богодухновенно и писалось мужами наполнеными Святым Духом — для этого нужно Родится Свыше и принять Крещение Святым Духом

В не изучении толкования Святых Отцов.

Библия это Духовная книга, поэтому её можно понимать только духовно.

там все понятно - но для этого не достаточно веры в бога, точнее она не обязательна. Но большая часть людей не способны думать сами.

Так как они писаны Символичным языком не для простых смертных!

есть новое понимание . рекомендую
https://youtu.be/YxxRZRCeU6Q

"И он сказал им: «Вам дано понять священную тайну царства Бога, а для остальных всё это только примеры, чтобы, смотря, они смотрели и не видели, и, слушая, слушали и не постигали смысла" (Марка 4:11,12).
"Тогда к нему подошли ученики и спросили: «Почему ты говоришь с ними, приводя примеры?» В ответ он сказал: «Вам дано понимать священные тайны небесного царства, а им не дано. Тому, кто имеет, будет дано больше, и у него будет изобилие, а у того, кто не имеет, будет отнято даже то, что он имеет. Поэтому я и говорю с ними, приводя примеры. Ведь они, смотря, смотрят впустую, и, слыша, слышат впустую, и не постигают смысла, и на них исполняется пророчество Иса́ии, которое гласит: „Слушая, будете слушать, но не будете постигать смысла; и, смотря, будете смотреть, но не будете видеть. Ведь сердце этого народа огрубело, они слышат, но не откликаются и закрыли глаза, чтобы не видели глазами, и не слышали ушами, и не постигали смысла сердцами, и не возвратились и чтобы я не исцелил их“. А ваши глаза счастливы, потому что видят, и ваши уши счастливы, потому что слышат" (Матфея 13:10-16).

С советами других. С тем, что некоторым противна свобода.