Чем отличается культ от секты?

По Сути только названием.

Культ (от лат. cultus) — почитание, поклонение.
Религиозный культ — религиозное почитание каких-либо богов и предметов (священные изображения, скульптуры); включающее обрядность и церемониальность

Се́кта (лат. secta — школа, учение, от лат. sequor — следую) — понятие (термин), используемый для обозначения религиозной группы, отделившейся от основного религиозного направления или указывает на организованную традицию, имеющую своего основателя.
В античной Греции С. первоначально означала философскую или юридич. школу или группу, затем — политич. группировку (у Цицерона).
Изначально слово «секта» было нейтральным термином для описания отдельных, обособленных политических, философских и религиозных групп.
Церковь придала этому термину значение «ересь» (от греч. hairesis, лат. secta — учение, направление, школа) в религиозном или церковно-политич. Смысле.
Наиболее известные зелоты — Симон (Шимон) Бар-Гиора и Йоханан из Гискалы. Иногда зелотов рассматривают как основанную Иудой Галилеянином и Садоком Фарисеем «четвёртую секту» (наряду с фарисеями, саддукеями и ессеями), о которых упоминал участник Иудейских войн Иосиф Флавий[2].

Культ - это почитание каких-то богов, обряды. А секта - это организация со своей структурой.
То есть получается, секта - это форма, а культ - это содержание.

Культ это поклонение чему либо. У секты не обязательно должен быть культ.

Количеством посетителей. У культа их больше.

написанием ...

то же самое, но в другой красивой обёртке

Под культом понимается, как правило чтимый Бог.
Секта это учение противоречащее основной религии.

одно и тоже

Культ - имеет почитаемую личность или божество. Секта - это часть религиозного направления. Это разные понятия.

у одного культа может быть несколько сект(пониманий)

Секта-это слово означает "выбор" или " то, что выбрано", и, как следствие, оно приобрело значение" группа людей, которые отделились от других и придерживаются своих собственных взглядов и принципов".
Основатель христианства, Иисус Христос, молился о том, чтобы среди его последователей царило единство, и его апостолы прилагали все усилия, чтобы сохранить единство в христианском собрании. В письме Титу апостол Павел написал, что того, кто распространял сектантство, после первого и второго увещания нужно было отвергнуть: " ...Эти люди незаметно введут сектантство, которое разрушает веру..." ( Библия. 2 Петра 2:1).
Культ и секта -это слова синонимы. Следовательно, для чистого поклонения истинному Богу сектантство и культ НЕПРИЕМЛЕМЫ.