Живем в двухквартирном доме. Расширили жилплощадь (сделали пристрой).

Увы, в Пенсионном фонде (не в местных органах власти, это не их компетенция) на этот счет правы. Внимательно читаем закон.

Статья 10. Направление средств материнского (семейного) капитала на улучшение жилищных условий

1. Средства (часть средств) материнского (семейного) капитала в соответствии с заявлением о распоряжении могут направляться:
2) на строительство, реконструкцию объекта индивидуального жилищного строительства, осуществляемые гражданами без привлечения организации, осуществляющей строительство (реконструкцию) ОБЪЕКТА ИНДИВИДУАЛЬНОГО ЖИЛИЩНОГО СТРОИТЕЛЬСТВА, в том числе по договору строительного подряда, путем перечисления указанных средств на банковский счет лица, получившего сертификат.

(Федеральный закон от 29.12.2006Г. N 256-ФЗ "О дополнительных мерах государственной поддержки семей, имеющих детей" (ред. от 29.12.2010г.) )

Объектами индивидуального жилищного строительства по действующему градостроительному законодательству (п. 3 ст. 48 Градостроительного кодекса РФ) являются отдельно стоящие жилые дома с количеством этажей не более чем три, предназначенных для проживания одной семьи. К нему (объекту индивидуального жилищного строительства) предъявляется требование нахождения на отдельном земельном участке. Данный вопрос уже рассматривался уполномоченными органами и по нему было получено отрицательное заключение. Смысл его заключается в том, что в двухквартирном доме часть конструкций и коммуникаций совместны и находятся в неразрывной связи, а за средства материнского (семейного) капитала может быть реконструировано только конкретное жилое помещение семьи владелицы сертификата, но никак не иных лиц.

Разумеется, можно попробовать обжаловать данное решение в суде, однако, вряд ли судьи настолько некомпетентны, чтобы не знать и не понимать подобных вещей, тем более, что заключения уполномоченных органов для них является догмой, а жалостью в таких случаях вряд ли продавишь, тем более, что в случае вынесения положительного решения Пенсионный его обжалует в кассационном порядке, а вышестоящих судах в таких вещах тем более разбираются. Боюсь, что обращение к "грамотному юристу" будет всего лишь пустой тратой времени и денег, а доли здесь и вовсе не при чём, это из совершенно другой оперы.
Хотя попробовать обжаловать можно, а вдруг прокатит...

местные власти или упфр рф.
полагаю, что есть смысл спорить - обжалуйте отказ упфр в суде. авось и примет суд вашу сторону.

для конкретного ответа нужно повозиться с вашими документами на дом - не на этом проекте. обратитесь к грамотному юристу в вашем регионе

уточните у вас доля в доме или квартира. посмотрите документ.