Почему программы в Linux имеют убогие интерфейс и функционал?

Это Вам так кажется, потому что под Windows пишут программисты, которые с этого имеют доход, и если программа по интерфейсу будет выделятся на фоне других конкурентирующих продуктов (да и вообще иметь вырвиглазный вид с синими огромными кнопочками и т. д.) , шанс того, что их творение купят существенно падает. Поэтому все надо сделать интуитивно понятно, красиво, написать подробные мануалы (с картинками... ) и т. д.
Если брать стандартный интерфейс, то тут далеко по сути не уйти, т. к. кнопка она и в Windows 95 кнопка и будет выглядеть и там примерно так же.

В Linux, вид любой программы настраивается по Вашему вкусу, потому что рендерингом всех графических элементов занимается менеджер окон. одна и та же программа может выглядеть по-разному, даже если не сравнивать KDE и Gnome, а просто другой рендер-движок выбрать в том же самом Gnome. Плюс темы, да.

линукс это opensource. Как когда-то один человек написал "в линуксе программисты пишут для программистов. в винде - программисты для пользователей. "

Кто тебе сказал такую глупость ?

Если приложение сделано на Qt и запускаешь ты его в КДЕ.. . то ничем не отличается визуально от Виндовз 7 (морду в котором спиздили именно с КДЕ4)

а вот, если приложение написано на ГТК - то да.. . ГТК выглядит страшно.. . и делать они, похоже ничего не собираются.. .

Насчет функционала это заблуждение. .
Просто не все что есть для линя. . подходит каждому. .
А только в меру его знаний. . и опыта. .
А насчет вида. . GNOME . KDE оболочки и т. д
Если разобраться думаю любым требованиям угодит. .
вопрос как глубоко разбираться (ИМХО)

На счет интерфейса: он не убогий, и как было сказано зависит от используейой графической среды, но даже в гноме его можно настраивать при помощи тем. Я считаю, что в интерфейсай nix программ есть другая проблема - он не унифицирован, как допустим у win прог. Так Amarok в каждой новой редакции имеет совершенно разный вид, а это не есть гуд.
На счет функционала, то я уже давно сижу (сейчас ксати тоже) в Linux и таких проблем не испытывал. Единственное, что если win программы это этакие комбаины, в которые создатели стараются впихнуть побольше возможностей (например nero сейчас ну разве что кофе не варит) а это делает их похожих на неповоротливых монстров. Средии nix программ расхожа концепция, согласно которой программ должно делать что то одно, но делать это очень хороше (может это и есть первоисточник мифа о их малом функционале)