Скажите, переустановка или смена операционной системы может стереть все файлы, папки и настройки?

Смотря как у Вас всё организовано!
Если у Вас 1 раздел, тогда придётся всё копировать на внешние носители!
Если Предусмотрительно 2-3 раздела и всё нужное хранится на них а не на C:\ то и беспокоиться неочем - тупо переустанавливаем и всё!

Аслан, не понятно, что вы хотите-систему переустановить или файлы сохранить.
По идеи, диск разбивают на два логических диска, на одном - винда (активный диск) ,
на втором - фильмы, фото, документы, музыка.. .
Вы уж определитесь.
Если винда накрылась, устанавливайте новую систему поверх старой, без форматирования диска!
Затем попробуйте "вытащить" нужные файлы программой R-Studio.

А устанавливать куда будешь? Если диск разбит на разделы, обычно C и D. Так вот сотрётся только диск С.

Если не форматируешь локальный диск, на котором стоит система, то файлы не сотрутся.
Единственное, все пользжовательские файлы с Рабочего стола и Мои документы стоит переместить непосредственно на сам локальный диск

Перед установкой новой операционной системы диск, на который она ставится, форматируется. Обычно документы и файлы держат на одном диске, а операционку на другом. Физически это может быть один диск, разбитый логически на два, например, диск С и диск D. Подоперационку обычно идет диск С. Если у Вас всего один диск и Вы собираетесь вытащить его из компьютера, то куда Вы будете ставить операционку?

лучше не рисковать и перекинуть на флешку