Жёсткий диск при переустановке Windows

У меня такая проблема: мне надо переустановить винду так как старая уже как 3 года не переустанавливалась.
У меня два харда на один из хардов я скину всю информацию и отключил его, предварительно проверив там всё на вирусы и прочую лабуду и этот хард новый.
А на втором харде, где винда щас стоит уже ничего не нужно, но я столкнулся с двумя вещами которые оставили у меня сомнение надо ли мне переустанавливать винду.
Первое: После переустановки винды с лицензионного диска трёх летней давности мне придётся скачивать все те тонны обновлений, которые я скачивал на протяжении трёх лет?
Второе: Диск основной старенький ему три года, проверка показала, что на нём есть один почти битый сектор да и секторов с плохой читаемостью тоже не мало на нём, и я слышал про програмку какуюту которая выравнивает сектора, делает качественное форматирование, вот меня это и итересует. Что это за програмка и как её использовать всмысле в биосе как-то возиться с ней надо? А как?
Вот что важно ещё тот диск, который со всеми файлами я отключу а после установки виндоус включу обратно, его новая винда будет видить? А то когдая первый раз второй диск поставил тор чтобы его просматривать его надо было в обязательном порядке форматнуть, а мне его уже форматировать ну никак нельзя.