Как сделать что бы программы не запускались во время запуска пк (skype например) ы

на windows 7 XP - пуск/ выполнить/ msconfig - закладка автозагрузка (убрать ненужные галочки)
на windows 8 - диспетчер задач - закладка автозагрузка (отключить ненужное)

Только очень осторожно и с умом )))

в Настройках программы снять галку автозапуск или галку запускать вместе с Windows

ставить восьмёрку - там в этом плане для простого пользователя хотя бы что-то сделали. в диспетчере задач настраивается вроде.

кроме автозапуска что виден в msconfig, программы любят прописывать себя для автозагрузки в самую жопу реестра винды - и просто так их не отключишь убрав галку, да и не будет их там в списке. Для убирания лишней хрени неплохо подходит утилита hijackthis

На Windows 7 например.
Пуск - Выполнить или нажать две клавиши Win (Значок Windows такой слева внизу на клаве) и R. В появившейся рамке прописать msconfig и нажать клавишу Enter. Появится окно, перейти на вкладку "Автозагрузка" и поснимать галочки с ненужных программ. Все, выйти, попросит перезагрузится. Согласись. Перезагрузится комп и все будет нормально. Хотя я обычно не перезагружаю до вечера и по фиг. Проблем не было из за этого.

Если чисто под скайп, то см. скриншот. А так используйте подсказки из предыдущих ответов

нажать одновременно кнопку windows + R, в окошке набрать msconfig, далее - автозагрузка и сбрасывай галки с прог, которые будешь запускать вручную.
В принципе, можно отключить все, кроме ctfmon, если ОС - ХР, то при следующем запуске поставить галку в выскочившем окне

убрать всё и з авто загрузки
(кроме антивируса

Спрашивали тут уже, используй: