Имеет ли право учитель, как захочет, говорить ученику за какую парту ему сесть? \

В должностных обязанностях преподавателя чётко указано, что только он имеет право разместить учеников в классе и обязан сделать это, причём может изменять это размещение в ходе учебного занятия, если это необходимо для учебного процесса (например, рассадить учеников по разным вариантам и не допустить списывания решений), если кто-то из учеников нарушает дисциплину (мешает другим ученикам, занимается посторонними делами, мешает преподавателю вести занятия), в случае медицинской необходимости (посадить на первую парту ученика с плохим зрением и т. п.), посадить за первые парты наиболее слабых учеников, чтобы осуществлять за ними контроль и оказывать им помощь в выполнении задания (может помочь, но НЕ ОБЯЗАН это делать). В общем, под такие случаи можно подвести что угодно.
Здесь есть очень существенное правило о том, что, например, если учитель решил пересадить ученика во время урока, то ученик ни в какой форме НЕ МОЖЕТ ОТ ЭТОГО ОТКАЗАТЬСЯ (отказ будет считаться нарушением учебной дисциплины) и должен выполнить распоряжение педагога. Если это распространяется только на этот урок, то это решение окончательное и пересмотреть его может только сам учитель. Если это распространяется на несколько уроков, а ученик не согласен с этим, то он может обратиться к администрации учебного заведения и аргументировать свой отказ. Аргумент может быть существенным (например, ученика с плохим зрением пересадили на заднюю парту, а он не видит, что написано на доске), и тогда решение отменят. Аргумент может быть признан несущественным (нарушителя дисциплины учитель пересадил на первую парту, чтобы контролировать его действия, а ученик заявляет, что сидеть на первой парте ему не нравится, хочет сидеть с конкретным соседом, в глаза бьёт солнце, неудобная парта и т. п.), и тогда решение могут оставить в силе.

Имеет, причем - ОБЯЗАН!
В учебном процессе правит балом УЧИТЕЛЬ, а не ученик.