Возможно ли несоответствие школьной программы и программы вуза?

Да. Технари страдают от того что у них в школе не было черчения. Все на ходу и с нуля в вузе приходиться учить. И что? Если это вас пугает, то все спец предметы, почти все, это новое которого до этого у вас не было. Но их надо учить и сдавать.

возможно

Собственно, они и не соответствуют. Нигде. Это, как бы, разные уровни образования.
А тот пример, который ты привел, совершенно некорректен. Если у вас в 11 классе не было информатики, ее не было по каким-то субъективным причинам, и это не совершенно не значит, что ее не было в программе средней школы. А требования к школьным знаниям для каждой специальности в вузе одинаковы для всех.

Бгг) Преподы говорят, что неважно, был предмет или нет - все равно 80% студентов не улавливают, о чем речь.
Не понимаешь - занимайся, отматывай назад материал, другого пути нет.

Почему они должны совпадать? В какой школе станут изучать например аэродинамику?

Вполне, ибо школьная программа в РФ и СНГ бестолковая и даже не подразумевает дальнейшее обучение где-то...

надо самому учить что в школе было

Не совсем.
Возможно, что в некоторых учреждениях среднего образования профильная программа чуть более углубленная и залазит в университетскую, так что выпускникам таких учреждений на первом курсе в вузах того же профиля чуть легче. Но в принципе программу должно быть возможно освоить и без этого углубления, хотя и будет казаться, что ты отстаёшь от одногруппников.