Вопрос к тем, кто летал на Бали через Токио. Меня интересует время между стыковкой рейсов, выход в город и т.д.

Самолет пребывает в Нариту в 8:25, а вылетает из Нариты в Денпасар в 16:10. Транзитная виза (Shore pass) позволяющая покинуть пределы аэропорта, выдается бесплатно на срок до 72 часов.
Для ее получения, перед паспортным контролем, необходимо обратиться на стойки Сounter A/shore pass, расположенные слева и справа от стоек паспортного контроля. Для получения визы необходимо предоставить следующие документы :
1. Заполненную иммиграционную карту ( выдается на борту самолета)
2. Паспорт
3. Авиабилет с подтвержденным дальнейшим перелетом в третью страну.
Однако японскую транзитную визу лучше все же оформить перед вылетом из Москвы, как Вам уже написали выше, поскольку ни авиакомпания, ни иммиграционные власти Японии не могут гарантировать автоматического предоставления Shore Pass по прибытию в Нариту. Удачи Вам и хорошего отдыха!! !

Это смотря какой авиалинией, каким рейсом.
Выход в город будет разрешён только если у вас есть японская виза (а её очень сложно получить) и много денежек (ибо Япония весьма дорога)

Для получения транзитной японской визы лучше побеспокоится заранее в японском консульстве, по крайней мере будете знать, что точно откажут. Вероятность отказа в получении транзитной визы в Японии достаточно велика. Как минимум основным условием является то, что самолёт вылетающий из Японии в конечный пункт должен быть ближайшим, а не специально подобранный через рейс или два.

Вообще-то до того как платить за билет вы уже должны знать время прилета и вылета и время нахождения в аэропорту трансфера. Время между стыковками рейсов тоже вы можете выбрать до оплаты билета. А вот про визу в Японию вам правильно написали.