платить ли налог если указал больше чем покупал, сумма указал 1000, продал указал 50000 менее 3 лет в собственности

Налог с продажи автомобиля не уплачивается гражданами при наличии следующих обстоятельств:

1.Отсутствие дохода при совершении сделки. Такое случается, к примеру, в ситуации, в которой продажа машины происходит по цене, не превышающей первоначальную стоимость автомобиля.
2.Длительное владение автомобилем перед продажей. Лицо, получившее доход от реализации собственности, которая принадлежала ему более 3 лет, не платит налог на доход.
3.Если стоимость продаваемой машины не превышает 250 000 рублей.

ты определись - 50000р или 50000 тысяч? Это вообще-то разные числа. Совсем разные.

50тысяч - налога нет, меньше чем 250 тысяч. Но подавать в налоговую надо.

Подать декларацию и указать налоговый вычет (до 250 т. р.) который покроет налог с продажи. Но декларацию подавать обязательно иначе штраф выпишут.

Если владел автомобилем больше трех лет, то никакой налог платить не надо.
Если владел автомобилем меньше трех лет, но при этом продал автомобиль дешевле, чем 250 000 рублей, то опять ничего платить не надо
Если машина продана дешевле, чем покупалась, то прибыли вы не получили, а значит и налог платить не нужно. Но учтите, что у вас должны быть документы, подтверждающие и покупку и продажу машины.
А вот если проездил на машине меньше трех лет и при этом продал ее дороже, чем 250 000 рублей, и при этом пункт 3 не подходит (например, нет документа купли-продажи), то необходимо заплатить подоходный налог в размере 13% от суммы, превышающей 250 000. Т. е., если машина продана за 350 000, то платить нужно будет 13% от 100 000, итого 13 000 рублей.
И еще один случай. Если проездил на машине меньше трех лет, продал дороже, чем купил и эта сумма больше 250 000 р. и при этом сохранились все документы, то платить 13% нужно только от прибыли. Например, вы купили машину 500 000 рублей, а продали за 510 000, тогда вам нужно заплатить 13% от 10 000, т. к. прибылью считается только эта сумма.
Так что, покупая автомобиль сегодня, стоит задуматься о его продаже. Сохраняйте все документы при приобретении своей машины.

декларируй правильно, а налоговая пришлет, если должен