Где зарплата больше в прокуратуре или в ФСБ, что престижней, что лучше?

Разные сферы деятельности.
Прокуратура Российской Федерации — единая федеральная централизованная система органов, в задачу которой входит осуществление от имени Российской Федерации надзора за соблюдением Конституции Российской Федерации и исполнением законов, действующих на её территории. Прокуратура Российской Федерации выполняет и иные функции, установленные федеральными законами. Полномочия, организация и порядок деятельности прокуратуры Российской Федерации определяются федеральным законом «О прокуратуре Российской Федерации». Является государственной военизированной организацией. В прокуратуре России предусмотрена федеральная военная, правоохранительная и гражданская государственная служба. Прокуратура должна осуществлять свои полномочия независимо от органов государственной (законодательной, исполнительной, судебной) власти, не относится ни к одной из ветвей власти.
ФСБ России — российская специальная служба, федеральный орган исполнительной власти Российской Федерации, осуществляющий в пределах своих полномочий решение задач по обеспечению безопасности Российской Федерации.
ФСБ России наряду с СВР России, ФСО России, ГФС России, ФСТЭК России и Службой специальных объектов при Президенте Российской Федерации относится к «силам и средствам обеспечения безопасности», то есть, к спецслужбам, как и ГРУ Генштаба Вооружённых Сил Российской Федерации. Наделена правом ведения предварительного следствия и дознания, оперативно-розыскной и разведывательной деятельности. В ФСБ России, как в Минобороны России предусмотрена военная и федеральная гражданская госслужба, что важно для установления судебной юрисдикции для начальников и сотрудников.
Руководство деятельностью ФСБ России осуществляется Президентом Российской Федерации.
Соответственно и разные зарплаты. Все зависит от должности, выслуги, звания и региона службы.
Престиж так же понятие растяжимое. К примеру престижней быть прокурором, нежели чем прапорщиком на КПП в ФСБ.

а честно зарабатывать - воспитание не позволяет?

мне всегда казалось что туда идут работать не за зарплату, престиж

ФСБ престижнее и зарплата выше, но всё же смотря какая должность