Деда зовут Илья, можно так же сына назвать? либо есть какая-то примета что нельзя называть именем, если в семье оно есть?

Не обращайте внимания на разные толкования примет.
Вспомните, сколько всегда было на Руси разных Иван Иванычей или Василь Васильичей. Да и Петров Сергеевичей с Сергеями Петровичами, бог знает, до какого колена, встречалось немало.
А наши предки очень осторожно относились ко всякого рода знакам.

Меня, например, назвали как мамину сестру, но не в её честь, а потому что родителям имя нравилось. Тётя больше 90 лет прожила.
У свекрови одну внучку назвали, как и её. Ей сейчас 83, вполне энергичная, правнуков на лето к себе зазывает.
Брат дал сыну то же имя, что и у папы. Тот тоже далеко за 80 перешагнул.

Так что не мучайтесь понапрасну, называйте малыша, как вам нравится. Главное, чтобы он любимым был.