Нашёл в бабушкином доме много кольев, а на них завязаны верёвки, на некоторых по две завязано! Что это?

Помидорные кусты подвязывала.

Не имеет магического смысла. Скорее всего бабушка использовала их в огороде. Наверное помидоры подвязывала.

Колышки - ценная вещь, не ищи второй смысл. В хозяйстве все нужно