Как сделать так чтоб при входе на мой сайт, незаметно качался файл и сразу запускался. Как это можно реализовать?

Как за**али ваши каникулы

Можешь по-другому нехорошие вещи попробовать пропихнуть:
1) Как нибудь обманом уговариваешь юзера скачать твой архив
2) Делаешь самораспаковывающийся архив (который бедный юзер и будет качать)
3) Этому архиву прописываешь в самооткрывание твою нехорошую вещь, которая там запихнута)

Это из области создания вирусов.

никак!
Если только пользователь сам не скачает!