могут ли возникнуть проблемы при замене видеокарты? например новая не подойдет по слоту

проблем не будет

слоты одинаковые

В твоём случае подойдёт по слоту, но вот мощность блока питания надо уточнить

Может не влезть в корпус и тогда придётся поработать напильником.

нет проблем не будет