Работник устраивается на работу специалистом по кадрам + полставки секретарем. Вопрос: прописать все в 1 трудовом догово

если секретарем он будет работать по внутреннему совместительству (ст. 60-1 ТКРФ) то договоров 2, но я полагаю, речь идет о совмещении (ст. 60-2), т. е. выполнение обязанностей по другой должности в основное рабочее время. В таком случае пропишите пунктом в трудовом договоре условие совмещения и оплату за него, а если совмещение в дальнейшем прекратится (это может произойти по инициативе как работника, так и работодателя при условии предупреждения другой стороны за 3 рабочих дня) оформить доп. соглашение к труд. договору