В среднем на каждые сто метров глубины она возрастает на три градуса... Какой член предложения "три"?

Три – не отдельный член предложения, это слово входит в состав обстоятельства НА ТРИ ГРАДУСА (все три слова подчеркиваются точкой-тире)

(по вопросу: возрастает как? на три градуса)