Где зарегистрироваться, чтобы винда и антивирусы не кричали на мою программу, что она от неизвестного издателя?

Пусть эти две дурные сущности (винда и антивирус) пищат, сколько им угодно -- не обращайте внимания. Это всего лишь означает, что она сделана неизвестным Васей и не имеет цифровой подписи. Ну и хрен с ней, главное -- эта программа полезна для вас.