можно ли поступить в военную академию после 5 лет обучения в колледже (неоконченное высшее)?

Во-первых понятия "незаконченное высшее" уже не существует, так же, как и такого "статуса" образования. Отменили, и слава богу, поскольку это чушь. У Вас сейчас, несмотря на пять потерянных лет, осталось то же образование, какое было до поступления в колледж. Во-вторых, для поступления в вуз (в том числе, и в военный) необходимы: аттестат о полном среднем образовании (за 11классов) ИЛИ диплом о среднем специальном образовании (диплом колледжа) , а также сертификат ЕГЭ (не просроченный) по тем предметам, которые нужны для поступления в академию на конкретную специальность. Если у Вас есть эти документы, можете попробовать поступать.