Является ли действительным кредитный договор когда после оформления на руках осталось обе копии договора?

Копия договора не имеет юридической силы. Если у Вас 2 оригинала, то один отнесите в банк, хотя формально можете и не относить. При отсутствии в банке оригиналов документов по взятому кредиту, банк формирует по Вашей задолженности 100 % резерва, в остальном ничего не меняется, для Вас тем белее ничего не меняется, так как есть еще документ чек-ордер, где Вы расписались за получение денег и другие подтверждающие факты для суда - например, видеозапись.