как налогооблагаются маленькие интернет магазины? и с какого дохода надо начинать "налогооблагаться"?

Если будете продавать в малых количествах по интернету, можете и не регистрироваться официально. Маловероятно, что попадете на проверку.
Нет такого понятия - сумма дохода, с которого надо регистрироваться официально.
По закону любая предпринимательская деятельность подлежит регистрации. Не регистрируясь, просто рискуете. Точно так же, как бабушки у метро, торгующие зеленью без оформления ИП.
Если объемы большие, конечно, нужно регистрировать ИП или ООО и платить налоги, выбрав оптимальную систему налогообложения.