при превращение периодической дробь на обыкновенный почему в знаменателе пишется 99, 999, 90, 9000,99999

Лучше это просто запомнить и не заморачиваться.
А так то 1/9 = 0,(1); 1/90 = 0,0(1); 1/900 = 0,00(1); 1/99 = 0,(01); 1/999 = 0,(001) и т. д.
Например, 0,(345) = 345 * 0,(001) = 345 / 999
Разные разряды можно девятками набрать.