как вести военный стол?

Стол вести не нужно- у него нет ног. Обратитесь в военкомат по месту регистрации и пусть они на флешке дадут все нормативные документы и инструкции. А еще в органах местного самоуправления (районная администрация) есть уполномоченный по мобилизационной работе, у него можно тоже получить консультацию. Если предприятие небольшое, то это ерунда. А если большое, то требуйте доплату за совмещение. Сейчас осень, время сдавать ежегодный отчет по воинскому учету.