Добрый день. Реорганизация путем присоединения. Как расторгнуть трудовой договор с директором правильно?

Правильно - это значит ТАК, чтобы у работника не возникло желания пожаловаться. Если реорганизация связана с сокращением численности работников, то действовать следует в рамках ТК РФ:
- предупредить не менее, чем за 2 месяца ( ст. 74 ТК РФ) ;

- подать сведения в службу занятости;

- предлагать любую работу;

- в последний рабочий день произвести все выплаты ( ст. 140, 178 ТК РФ).