почему в помидорах нет косточек

Потому что это не сливы. Они размножаются семенами.

У вас помидор является домашним животным? Странный вы вопрос задали по категории "Домашние животные"

В них есть косточки, только совсем маленькие С:

косточки есть но они средних размеров

Возможно потому что гибрид?

потому что там не косточки, а семечки