1) Камеральная проверка производится исключительно на основании данных деклараций и сведений уже имеющихся у ФНС. Если Вы не подавали декларацию по НДС с возмещением налога, не пользовались льготами, то у ФНС нет никаких прав писать требования о представлении документов, а у Вас соответственно нет обязанности их представлять. Многочисленные письма Минфина подтверждают это. Единственным исключением для ИП это КУДИР, которую ФНС может затребовать в любое время, но КУДИР это 1 документ, и соответственно штраф будет как за непредставление 1 документа.
2) В случае обнаружении ошибок ФНС ОБЯЗАНА запросить пояснения (Требования о представление пояснений) , либо внесения изменений в налоговую декларацию. Без этого она не имеет права составлять Акт проверки. Посмотрите, было ли письмо с требование о представлении пояснений, если нет Акт составлен неправомерно.
3) Что написано в Акте, за что штрафуют? Если за непредставление документов, то смотрим п. 1, обжалуем в УФНС.
Если по данным налоговой декларации и информации имеющейся у ФНС доначислили налоги, то тут уже надо конечно разбираться конкретно...