В ходе проведения налоговым органом камеральной проверки по налоговой декларации, поданной налогоплательщиком, был устан

Правомерны. установлен факт нарушения Налогового законодательства. Пересчитана налоговая база. доначислен налог с новой базы. начислены пени -за несвоевременную оплату налога. А проще выявлена -недоимка по налогу. начислены пени.. и штрафы. Наличие переплаты на лицевом счете-это совсем другое. Право налогового органа выявленные : недоимку-списать за счет переплаты налога. пени и штрафы выставить на инкассо. штраф на должностное лицо-оплачивается лично из собственного дохода. штраф на предприятие-за счет средств предприятия.

Это статья Статья 122. Неуплата или неполная уплата сумм налога (сбора)
При переплате штрафа нет.
А вот занижение налоговой базы идет по Статья 120. Грубое нарушение правил учета доходов и расходов и объектов налогообложения

В соответствии с Определением Конституционного Суда РФ от 18.01.2001 N 6-О положения пунктов 1 и 3 статьи 120 и пункта 1 статьи 122, определяющие недостаточно разграниченные между собой составы налоговых правонарушений, не могут применяться одновременно в качестве основания привлечения к ответственности за совершение одних и тех же неправомерных действий.
В результате занижения налоговой базы не было недоимки.

Нет, неправомерны. В п. 42 Постановления от 28.02.2001 № 5 "О некоторых вопросах применения части первой Налогового кодекса Российской Федерации" Пленум ВАС РФ разъяснил, что неуплата или неполная уплата сумм налога означает возникновение у налогоплательщика задолженности перед соответствующим бюджетом по уплате налога. В связи с этим, если в предыдущем периоде у налогоплательщика имеется переплата определенного налога, которая перекрывает или равна сумме того же налога, заниженной в последующем периоде и подлежащей уплате в тот же бюджет, и упомянутая переплата не была ранее зачтена в счет иных задолженностей по данному налогу, состав правонарушения, предусмотренный ст. 122 НК РФ, отсутствует. Ведь занижение суммы налога не привело к возникновению задолженности перед бюджетом в части уплаты конкретного налога.