могут ли мышцы атрофироватся из за сильной нагрузки? ну к примеру слишком частые походы в качку)

да, при частом качании, не правильной нагрузке мышцы не растут, они привыкают, как у грузчиков. Поэтому надо менять нагрузки, упражнения.