Можно ли получить лицензию на медицинскую деятельность, если имущество находится в частной собственности?

Да, это одно из основных требований.
4. Лицензионными требованиями и условиями при осуществлении медицинской деятельности являются:
а) наличие у соискателя лицензии (лицензиата) принадлежащих ему на праве собственности или на ином законном основании соответствующих помещений;