Во-первых, атомы есть разные (и это главная причина) . Открой таблицу Менделеева.
Во-вторых, смешать и упаковать их можно по-разному. Из десяти пряников шоколад может и не получится, но если взять уголь и хорошо шлёпнуть высоким давлением, то может получиться алмаз. (В домашних условиях шлёпать не пытайтесь. Тут не тапком по полу нужно бить, а, скажем так, скорым поездом по площадке в квадратный сантиметр) . Так и получаются искусственные алмазы. (Открою секрет, естественные алмазы тоже так получились, миллионы лет назад) .
Или, например, берут бензин (жидкость) , добавляют обычный воздух и поджигают всё это. И всё это клёво исчезает. Двигатель называется. На самом деле не исчезает, конечно, а образуются водяной пар и углекислый газ.