Немного дополню Алекса. Например ластоногих метят клеймлением. Китообразных внешними метками, позволяющих при внешнем наблюдении идентифицировать животных. Рыбу тоже метят разными способами - просто метки закрепленные на теле рыб, электронные метки пассивные, активные, радиометки, частичным обрезанием плавников и жабкрышек, разными методами добиваются отложения дополнительных колец на отолитах (рыборазводные заводы) и т. д.
Лично занимался мечением лососей в море пластиковыми метками закрепленными за спинным плавником и миног пассивными метками внедренными под кожный покров.
Цель - учет количества крупного морзверя, идентификация рыб разных группировок и популяций, контроль миграций и т. д.
Это и означает "регистрация и учёт". По-разному метят и регистрируют. Мелочь - пчелиными метками, метками на плавниках (металлическими, пластиковыми или просто выстригают лучи) радиометками. И регистрируют соответственно. При вылове, в бинокль или с помощью локатора.