Скажите, могут ли выписать человека без его согласия. Собственником не является. Частный дом

Прописки и выписки не существует уже 20 лет.
Регистрация по месту жительства или пребывания не даёт прав на собственность.
Что Вас беспокоит?

Как он оказался там зарегистрированным?

Выписать из приватной квартиры можно любого кавртиранта (квартиросъёмщика) без его согласия и без предоставления другой жилой площади. Важно, чтобы он был заблаговременно извещён (желательно письменно, под расписку) о прекращении договора-найма квартиры по инициативе собственника.

Через суд.

Конечно можно, подавайте иск в суд о прекращении права пользования жилым помещением и снятием с рег. учета