чем лучше пользоваться? edius 5.50 или 6ю02 ?

это правда некритично.

там разница в поддержке проф проприетарных форматов

5.5. Она удобнее. Одно то что в 6.08 при разрезке выделяется правая часть -большой минус. Попробуйте монтировать в мультикаме и увидите это.
В шестерке убрали 3д рIp-нормальный инструмент на который наработано куча пресетов и впихнули это в лаутер. В 6-ке вместо инструмента регион сделали маски. Хорошо это или плохо? лучше бы оставили все и добавили новое не трогая идеальный интерфейс и настройки к которым привыкли тысячи пользователей.