Что делать с баклажанами?

Путь только один, хотя поможет или нет.. . Повылавливать и содрать шкурку.

Выбросить и не жалко.
При употреблении баклажанов ( в кожуре) , зеленой картошки ( местами) в пищу следует учитывать наличие в них соланина М, который в значительных количествах является сильным ядом, вызывающим местное воспаление пищеварительного канала.

Если в блюде, то уже ни как, разве что выковырять от туда.

Уже ни как. Пару лет со всех баклажан срезаю шкурку.

никак по моему. было раз такое, старого огромного порезала со шкуркой в рагу. пыталась вылавливать и плюнула. оно и не жевались к тому же ещё

Ну добавьте чего-нибудь: масла нерафинированного подсолнечного, уксуса, сахара, соли, перца душистого или красного горького, сухого или свежего измельченного укропа, петрушки, тмина, кориандра, фенхеля, сельдерея, эстрагона (тархуна) , тертой жареной морковки, тертого чеснока, жареного репчатого лука, помидориков (можно горячих) , перчика сладкого/болгарского, поджаренной муки, распареной манки, отваренного на воде риса, сыра, сметаны, кефира и т. д. Все зависит от того, что у Вас за блюдо!
В общем сделайте мешанину и пробуйте как оно там стало выглядеть. Ну а вообще вкус и сам собой изменится от нагревания, от охлаждения/замораживания. Так что может быть надо только дать вашему блюду постоять немного. . .Время лечит знаете ли...

Скорее всего уже никак не исправить.
На стадии готовки посолить довольно густо, подождать пока дадут сок, слить его долой, кусочки баклажанов промыть чистой водой хорошенько и только потом пускать в дальнейшую обработку.
А в готовое блюдо попробуйте добавить чеснок.
Соланин - алкалоид растений семейства пасленовых (от него например, прозеленяется картофель) , он имеет горький вкус и ядовит.