мой попугай кричит если его клетка не закрыта можно ли его держать в темноте

Да. Клетку закрывай, можно тряпочкой накрыть

вопрос не совсем ясен, расставьте знаки препинания. если я правильно поняла то 1.закрывайте клетку. 2.можно

Похоже, Ваш попугай - параноик!