карликовым яблоням 3 года на листьях появились бурые пятна, нижние сохнут, опадают, верхние скручиваются в трубку.

Бурые листья (бактериоз) и скручивание верхних - работа тли. Обрабатывать нужно было. Теперь в конце сентября 10% амм. селитра или мочевина по кроне и приствольные круги. С зимы по схеме. См. мои ответы

Если на Севере живёте - это осень, если в южных широтах надо деревца обрезать как обычно, стряхнуть пожухлые листики, все эти отходы сжечь, а деревца полностью опрыскать бордосской жидкостью 3%, чтоб всю зиму они стояли голубые. Весной до распускания почек обработку повторить. Яблони, как и все плодовые деревья, для предотвращения заболеваний надо регулярно по схеме обрабатывать, потому что такие болезни как чёрный рак и парша не лечатся.