пособии по беременностям и родам

Так. По порядку. Она должна вам при выходе в декрет принести больничный лист на 140 дней и если есть, то справку за ранние сроки постановки на мед. учет. От вас нужно копию приказа о ее трудоустройстве, расчет пособия и платежные ведомости о том, что вы ей этот больничный оплатили. у вас на тот момент обязательно должен быть оплачен ЕНВД за последний квартал, иначе не возместят.
Расчитываете исходя из минимальной зарплаты 4330 рублей, потому что это минимум, а у вам зарплата меньше.
Считаете среднедневную зарплату и умножаете на 140 дней больничного. Больничный надо заполнить с обратной стороны.
Потом еще заполняете промежуточную ведомость ФСС - 4 и несете все копии и больничный лист в ФСС. И ждете возмещения.
Когда она родит, то процедура та же, только надо еще св - во о рождении, справку из ЗАГСа, справку с места работы мужа, что там не получал пособие и опять платежную ведомость, что выдали ей пособие по рождению. И снова в ФСС за возмещением. Потом также пособие по уходу до 1, 5 лет.

у вас работник на неполном рабочем дне, при расчете больничного возникнут проблемы.
или сходить в соц. страх и попросить помочь расчитать или нанять опытного буха

Вам надо сосчитать среднедневной заработок, для этого суммируете всю НАЧИСЛЕННУЮ зарплату и делите на кол-во отработанных КАЛЕНДАРНЫХ дня (при условии что она не болела) , получаете цифру, её умножаете на 140 дней декрета и получаете сумму, подоходным не облагаете, страховыми взносами в ПФ вроде тоже.