Нужно ли ставить на баланс ОС(склад металлический), если он куплен 2 сентября за 100 т.р. и продан 29 сентября за 100 т.

Оприходуйте его как товар на 41 и дальше обычная реализация

Амортизации однозначно не будет начисляться, ее начисляют с 1- числа следующего месяца. Налог на имущество тоже не будет начисляться, ведь не будет остатков ни 01.09 ни на 01.10. Склад не будет считаться ОС, тут не выполняется 2 условия ( б) и в) по которым ОС может считаться ОС
4. Актив принимается организацией к бухгалтерскому учету в качестве основных средств, если одновременно выполняются следующие условия:
а) объект предназначен для использования в производстве продукции, при выполнении работ или оказании услуг, для управленческих нужд организации либо для предоставления организацией за плату во временное владение и пользование или во временное пользование;
б) объект предназначен для использования в течение длительного времени, т. е. срока продолжительностью свыше 12 месяцев или обычного операционного цикла, если он превышает 12 месяцев;
в) организация не предполагает последующую перепродажу данного объекта;
г) объект способен приносить организации экономические выгоды (доход) в будущем.
Лучше на 41 счет оприходовать, если в течение одного месяца движение.

ядумаю надо поставить и списать и вся проблема. и все будет в порядке.

нет, наверное

на 01 днозначно не надо ставить, лучше на 41 надо было наценить товар хотя бы на 1 рубль у Вас нет экономической обоснованности получения прибыли ведь приобретали для перепродажи.